La Institución cuenta en la actualidad con las siguientes modalidades de pago:
- Pago electrónico PSE
- Tarjetas débito y crédito
- Crédito a corto plazo en alianza con Fincomercio o Itaú.
- Crédito mediano plazo en alianza con Icetex y Sufi de Bancolombia
- Crédito a largo plazo Icetex
- Crédito directo
Todos los trámites ante el Icetex deberán realizarse en la página web www.icetex.gov.co en las fechas establecidas por el Instituto. Las demás alternativas de pago se realizan en las instalaciones de Uniagraria, para lo cual ha dispuesto en los períodos de matrícula la Sala de Apoyo Financiero.