Fue UNIAGRARIA  concebida por sus fundadores, como un instrumento educativo de nivel superior para contribuir a la formación del talento humano indispensable para el desarrollo de la comunidad regional y rural del país, conformada por más de 12 millones de almas, haciendo énfasis en la población campesina que se reúne en unos 2,8 millones de familias dispersas en los 1100 municipios que conforman la región y  el territorio nacional, desarrollo que no solo se enfoca en el mejoramiento de la producción y productividad económica de las parcelas, sino que hace énfasis en el factor HUMANO y su concepción integral como persona y como comunidad., necesitadas ambas de apoyos en la cultura, la historia, el arte, la música, la literatura y muchas otras facetas que favorecen el logro de la felicidad; condición que cada vez es más visible e indispensable para la permanencia del hombre rural y su familia en el territorio, y disminuir así la migración hacia las grandes ciudades. 

Nuestra identidad surge de la manera coherente y armónica como se desarrollan las actividades educativas como Institución Universitaria, de cara a los emprendimientos para la solución de problemas reales de los habitantes del territorio, la protección del ambiente y de la cultura rural, miradas desde la formación del talento humano necesario para ello. El reconocimiento del poder económico del campo y de sus potencialidades para la alimentación y el futuro sostenible de la humanidad, además del estudio de sus interrelaciones con los centros urbanos, es nuestro propósito como fundación y como ente educativo. Es la virtud con que lo logramos, lo que nos diferencia de instituciones similares. 

El quehacer de la Institución, en consonancia con el PEI, se fundamenta en la calidad, la pertinencia y la internacionalización; además en valores como el respeto, la tolerancia, la coherencia, el bien común, la confianza, la justicia, y prioriza los principios del humanismo, disciplina, liderazgo, excelencia e innovación, por lo cual, desde su concepción, la Institución se ha caracterizado por la vocación y el compromiso con la sustentabilidad ambiental, la cultura del emprendimiento y el desarrollo regional con enfoque territorial; pilares misionales que la han llevado a convertirse en la “U Verde de Colombia”. 

En más de 30 años de existencia, UNIAGRARIA ha logrado avances significativos en la consolidación de sus postulados fundacionales y concreción los tres pilares misionales arriba mencionados, que estructura el SER y que se han explicitado como sello diferenciador en las funciones sustantivas de docencia, investigación y extensión. La impronta del SER uniagrarista, siguiendo los lineamientos del PEI desde el Modelo Pedagógico y la Política Curricular, se concreta en las competencias básicas generales, disciplinares y por supuesto institucionales, con los respectivos resultados de aprendizaje que caracterizan a los egresados de la Institución y constituyen el factor diferenciador frente a profesionales o posgraduados de otras Instituciones de Educación Superior. 

De igual manera, la impronta del SER uniagrarista, se cultiva también desde la investigación, exaltando la formación en investigación a través de diversas estrategias encaminadas a contribuir a la solución de problemas reales; pero también a la satisfacción de necesidades visibles de la comunidad a través de la investigación aplicada y la transferencia de conocimientos afines con el desarrollo regional y rural sostenible, el emprendimiento y la innovación y la conservación del ambiente. La integración de las funciones sustantivas y de los pilares misionales está también presente en el relacionamiento con el sector externo, especialmente el regional y rural, visible a través de programas y proyectos propios del SER uniagrarista, como el SISTEMA SEMBRAR PAZ, UNIAGRARIA al Campo, Plan 500 Colegios Verdes para Colombia, Madrugadas Rurales, Educación en Contextos Rurales,  la creación de Sedes y Centros Regionales, y muchos otros  proyectos propios de las disciplinas de los programas académicos que oferta la Institución. Nuestra identidad es también palpable en nuestro Himno Institucional y nuestra Bandera.